Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lgr5Q9Z1P4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms