Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sh3bgrQ9WUZ7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sh3bgrQ9WUZ7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms