Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nek3Q9R0A5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nek3Q9R0A5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek3Q9R0A5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nek3Q9R0A5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nek3Q9R0A5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nek3Q9R0A5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nek3Q9R0A5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nek3Q9R0A5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nek3Q9R0A5 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Nek3Q9R0A5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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