Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms