Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Col4a4Q9QZR9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Col4a4Q9QZR9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Col4a4Q9QZR9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a4Q9QZR9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Col4a4Q9QZR9 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Col4a4Q9QZR9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a4Q9QZR9 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Col4a4Q9QZR9 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms