Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ChmlQ9QZD5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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ChmlQ9QZD5 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChmlQ9QZD5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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