Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYL7

Abt1, Activator of basal transcription 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abt1Q9QYL7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms