Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rdh11Q9QYF1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rdh11Q9QYF1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms