Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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VapbQ9QY76 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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VapbQ9QY76 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
VapbQ9QY76 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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