Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nphp1Q9QY53 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms