Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr2e3Q9QXZ7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms