Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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