Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Trim44Q9QXA7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim44Q9QXA7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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