Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Csnk1eQ9JMK2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Csnk1eQ9JMK2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms