Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Mrpl39Q9JKF7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms