Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl28Q9JIL2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms