Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms