Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.8 ms