Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tlr1Q9EPQ1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms