Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Syde1Q9DBZ9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms