Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrpraQ9DBG7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms