Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pop5Q9DB28 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms