Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smco2Q9DA21 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smco2Q9DA21 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms