Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c6Q9D8P7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms