Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mrpl17Q9D8P4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl17Q9D8P4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl17Q9D8P4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl17Q9D8P4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl17Q9D8P4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl17Q9D8P4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl17Q9D8P4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl17Q9D8P4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Mrpl17Q9D8P4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms