Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Derl3Q9D8K3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms