Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Echdc3Q9D7J9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Echdc3Q9D7J9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Echdc3Q9D7J9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Echdc3Q9D7J9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Echdc3Q9D7J9 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Echdc3Q9D7J9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Echdc3Q9D7J9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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Echdc3Q9D7J9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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