Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ccdc7Q9D541 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc7Q9D541 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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