Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Phf6Q9D4J7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Phf6Q9D4J7 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Phf6Q9D4J7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phf6Q9D4J7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms