Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms