Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cfap53Q9D439 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Cfap53Q9D439 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cfap53Q9D439 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cfap53Q9D439 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cfap53Q9D439 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cfap53Q9D439 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cfap53Q9D439 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cfap53Q9D439 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cfap53Q9D439 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cfap53Q9D439 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cfap53Q9D439 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cfap53Q9D439 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cfap53Q9D439 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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