Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Trappc6bQ9D289 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms