Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmbr1lQ9D1E5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms