Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms