Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Susd3Q9D176 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Susd3Q9D176 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Susd3Q9D176 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Susd3Q9D176 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Susd3Q9D176 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Susd3Q9D176 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms