Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zbed3Q9D0L1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zbed3Q9D0L1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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