Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2e1Q9D0D5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms