Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mms19Q9D071 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mms19Q9D071 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms