Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc47Q9D024 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc47Q9D024 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc47Q9D024 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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