Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cmss1Q9CZT6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms