Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa9Q9CZN4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms