Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ04

Cops7a, COP9 signalosome complex subunit 7a, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7aQ9CZ04 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cops7aQ9CZ04 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms