Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Xrcc3Q9CXE6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms