Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nicn1Q9CQM0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms