Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ccer1Q9CQL2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ccer1Q9CQL2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ccer1Q9CQL2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccer1Q9CQL2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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