Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms