Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rab5aQ9CQD1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rab5aQ9CQD1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Rab5aQ9CQD1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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