Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
1700029P11RikQ9CQ68 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms