Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Use1Q9CQ56 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Use1Q9CQ56 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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