Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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